Saúde

Estudo genômico identifica rotas de transmissão do coronavírus em lares de idosos
A vigilância genômica - usando informações sobre as diferenças genéticas entre as amostras de vírus - pode ajudar a identificar como o SARS-CoV-2 se espalha em lares de idosos, cujos residentes estão em risco particular, aponta estudo
Por Craig Brierley - 03/03/2021


Pessoa usando aliança de casamento - Crédito: Instituto Nacional do Câncer

Pessoas mais velhas, especialmente aquelas em lares de idosos que podem ser frágeis, correm risco especial de COVID-19, por isso é essencial que façamos tudo o que pudermos para protegê-los

Estee Torok

Os lares de idosos correm alto risco de surtos de COVID-19, a doença causada pela SARS-CoV-2. Idosos e pessoas afetadas por doenças cardíacas, respiratórias e diabetes tipo 2 - que aumentam com a idade - correm o maior risco de doenças graves e até mesmo de morte, tornando a população de lares de idosos especialmente vulnerável.

Os lares de idosos são conhecidos por serem locais de alto risco para doenças infecciosas, devido a uma combinação da vulnerabilidade subjacente de residentes que muitas vezes são frágeis e idosos, o ambiente de vida compartilhado com vários espaços comuns e o alto número de contatos entre residentes, funcionários e visitantes em um espaço fechado.

Em uma pesquisa publicada hoje na eLife , uma equipe liderada por cientistas da Universidade de Cambridge e do Wellcome Sanger Institute usou uma combinação de sequenciamento do genoma e informações epidemiológicas detalhadas para examinar o impacto do COVID-19 em lares de idosos e observar como o vírus se espalha nessas configurações.

O SARS-CoV-2 é um vírus de RNA e, como tal, seu código genético está sujeito a erros cada vez que se replica. Atualmente, estima-se que o vírus sofre mutação a uma taxa de 2,5 nucleotídeos (A, C, G e U de seu código genético) por mês. Ler - ou 'sequenciar' - o código genético do vírus pode fornecer informações valiosas sobre sua biologia e transmissão. Ele permite que os pesquisadores criem 'árvores genealógicas' - conhecidas como árvores filogenéticas - que mostram como as amostras se relacionam entre si.

Cientistas e clínicos em Cambridge foram os pioneiros no uso de sequenciamento do genoma e informações epidemiológicas para rastrear surtos e redes de transmissão em hospitais e estabelecimentos de saúde comunitários, ajudando a informar medidas de controle de infecção e quebrar as cadeias de transmissão. Desde março de 2020, eles têm aplicado esse método ao SARS-CoV-2 como parte do Consórcio COVID-19 Genomics UK (COG-UK).

Neste novo estudo, os pesquisadores analisaram amostras coletadas de 6.600 pacientes entre 26 de fevereiro e 10 de maio de 2020 e testadas no Laboratório de Saúde Pública da Inglaterra (PHE) em Cambridge. De todos os casos, 1.167 (18%) eram residentes de lares de idosos de 337 lares de idosos, 193 dos quais eram lares residenciais e 144 lares de idosos, a maioria no leste da Inglaterra. A idade média dos residentes de lares era de 86 anos.

Enquanto o número médio de casos por lar de idosos foi dois, os dez lares de idosos com o maior número de casos foram responsáveis ​​por 164 casos. Houve uma ligeira tendência de as casas de saúde terem mais casos por casa do que as residências, com uma mediana de três casos.

Em comparação com os residentes de lares que não assistem internados no hospital com COVID-19, os residentes de lares hospitalizados têm menos probabilidade de serem admitidos em unidades de terapia intensiva (menos de 7% versus 21%) e mais probabilidade de morrer (47% versus 20%) .

Os pesquisadores também exploraram as ligações entre asilos e hospitais. 68% dos residentes de lares de idosos foram internados no hospital durante o período do estudo. 57% foram admitidos com COVID-19, 6% dos casos tiveram suspeita de infecção hospitalar e 33% tiveram alta hospitalar no prazo de 7 dias após um teste positivo. Essas descobertas destacam as amplas oportunidades para a transmissão do SARS-CoV-2 entre hospitais e lares de idosos.

Quando os pesquisadores examinaram as sequências virais, eles descobriram que para vários dos lares de idosos com o maior número de casos, todos os casos agrupados em uma árvore filogenética com genomas idênticos ou apenas uma diferença de par de bases. Isso foi consistente com a propagação de um único surto dentro da casa de saúde.

Em contraste, para vários outros lares de idosos, os casos foram distribuídos pela árvore filogenética, com diferenças genéticas mais difundidas, sugerindo que cada um desses casos era independente e não relacionado a uma fonte de transmissão compartilhada.

“Os idosos, especialmente aqueles em lares de idosos que podem ser frágeis, correm um risco particular com o COVID-19, então é essencial que façamos tudo o que pudermos para protegê-los”, disse a Dra. Estée Török, Consultora Honorária do Hospital Addenbrooke, em Cambridge University Hospitals (CUH), e um honorário Senior Visiting Fellow na University of Cambridge.

“Prevenir a introdução de novas infecções em lares de idosos deve ser uma prioridade fundamental para limitar os surtos, juntamente com os esforços de controle de infecção para limitar a transmissão dentro de lares de idosos, inclusive assim que um surto for identificado.

A equipe encontrou dois grupos vinculados a profissionais de saúde. Um deles envolveu residentes de uma casa de repouso, um cuidador dessa casa e outro de uma casa de saúde desconhecida, paramédicos e pessoas que viviam com eles. O segundo envolveu vários residentes de lares de idosos e equipes médicas agudas do Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust que cuidaram de pelo menos um dos residentes. Não foi possível dizer de onde esses clusters se originaram e como o vírus se espalhou.

“Usar esta técnica de 'vigilância genômica' pode ajudar instituições como lares de idosos e hospitais a entender melhor as redes de transmissão que permitem a disseminação do COVID-19”, acrescentou o Dr. William Hamilton da Universidade de Cambridge e CUH. “Isso pode informar as medidas de controle de infecção, ajudando a garantir que esses locais sejam o mais seguros possível para residentes, pacientes, funcionários e visitantes.”

O número absoluto de casos diagnosticados de COVID-19 de residentes de lares diminuiu mais lentamente em abril do que para residentes de lares sem assistência, aumentando a proporção de casos de lares de idosos e contribuindo para a lenta taxa de declínio no número total de casos durante abril e no início Maio de 2020.

“Nossos dados sugerem que a transmissão em lares de idosos era mais resistente às medidas de bloqueio do que os ambientes sem lares. Isso pode refletir a vulnerabilidade subjacente da população de lares de idosos e os desafios de controle de infecção de vários residentes de enfermagem que também podem compartilhar espaços comuns ”, disse Gerry Tonkin-Hill do Instituto Wellcome Sanger.

A equipe não encontrou novas linhagens virais de fora do Reino Unido, o que pode refletir o sucesso das restrições de viagens em limitar a introdução de novos vírus na população em geral durante a primeira onda epidêmica e o período de bloqueio.

Este trabalho foi financiado pelo COG-UK, Wellcome, a Academy of Medical Sciences, a Health Foundation e o NIHR Cambridge Biomedical Research Center.

 

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