Saúde

Pesquisadores identificam novas bactérias e vírus na pele humana
Acredita-se que o microbioma da pele desempenhe um papel fundamental na saúde e nas doenças da pele. Certos microrganismos no microbioma da pele estão associados a diferentes doenças da pele, incluindo acne e eczema.
Por Laboratório Europeu de Biologia Molecular - 05/01/2022


Dados que representam a ampla gama de micróbios encontrados no microbioma da pele humana. Crédito: Karen Arnott / EMBL

Pesquisadores do Instituto Europeu de Bioinformática do EMBL (EMBL-EBI), do Instituto Nacional de Pesquisa do Genoma Humano (NIH) do Instituto Nacional de Pesquisa do Genoma Humano (NHGRI), do Instituto Nacional de Artrite e Doenças Musculoesqueléticas e de Pele do NIH e colegas identificaram novas espécies bacterianas e fúngicas , bem como vírus no microbioma da pele humana.

Microbiomas - comunidades de microrganismos - são encontrados em todos os lugares, desde os oceanos e o solo até o intestino humano e a superfície da pele . Acredita-se que o microbioma da pele desempenhe um papel fundamental na saúde e nas doenças da pele. Certos microrganismos no microbioma da pele estão associados a diferentes doenças da pele, incluindo acne e eczema.

Neste estudo, publicado na Nature Microbiology , os pesquisadores sequenciaram os genomas dos microrganismos detectados em 594 amostras retiradas de várias superfícies da pele de 12 voluntários saudáveis. Combinando o cultivo de laboratório tradicional com uma abordagem de sequenciamento metagenômico, os pesquisadores foram capazes de criar a Skin Microbial Genome Collection (SMGC) - uma coleção de genomas de referência para o microbioma da pele humana.

Diversidade no microbioma de nossa pele

"Descobrimos milhares de sequências virais , incluindo muitos fagos jumbo - vírus muito grandes que infectam bactérias - mais comumente na superfície das mãos e pés de nossos voluntários", disse Sara Kashaf, Ph.D. estudante do NIH e do EMBL-EBI. "Essas áreas do corpo têm microbiomas altamente diversos, o que faz sentido porque estamos constantemente usando nossas mãos para tocar novas coisas em nosso ambiente. Nosso trabalho futuro terá como objetivo entender o que esses diferentes micróbios estão fazendo nessas comunidades."

Os pesquisadores usaram métodos extensivos de cultura de laboratório, sequenciamento metagenômico e metagenomas de pele disponíveis ao público para obter esses novos insights sobre a extensão da diversidade dentro do microbioma da pele. Este estudo focou principalmente em indivíduos da América do Norte, mas o trabalho futuro terá como objetivo expandir o SMGC usando amostras de diferentes populações.

"Este trabalho é um passo importante para a obtenção de um projeto genômico completo do microbioma da pele", disse Julie Segre, pesquisadora sênior do NHGRI. "Esperamos que esses dados apoiem futuras investigações, melhorando nossa compreensão da saúde e doenças da pele."

Novos eucariotos, bactérias e vírus

A coleção SMGC inclui 174 espécies bacterianas até então desconhecidas, quatro novos eucariotos e 20 novos fagos jumbo - vírus com um genoma maior do que 200 kilobases, 3-5 vezes maior do que um vírus médio. Os pesquisadores trabalharam anteriormente com um conhecimento incompleto da composição bacteriana do microbioma da pele. No entanto, esta pesquisa expande o catálogo de bactérias cutâneas conhecidas em 26%.

"Além das bactérias e vírus que normalmente recuperamos na metagenômica, também encontramos doze genomas de eucariotos unicelulares - fungos, como leveduras - da pele humana. Alguns desses genomas já eram conhecidos, como Malassezia globosa, que tem foi associado ao micobioma de pele saudável, mas também foi associado a doenças como a caspa. Usar os mesmos métodos que recuperaram oito genomas conhecidos nos dá confiança nos quatro novos eucariotos que encontramos ", disse Rob Finn, líder do grupo EMBL-EBI . "Observar os padrões desses novos eucariotos revelou que um deles era muito comum entre os voluntários e pode ser encontrado em muitos de nós."

Todos esses dados serão disponibilizados gratuitamente em breve como um novo catálogo de genoma no recurso de dados MGnify, onde os pesquisadores podem encontrar uma grande variedade de conjuntos de dados de microbioma, incluindo para o intestino humano .

 

.
.

Leia mais a seguir