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Oxford e Oracle fazem parceria para acelerar a identificação de variantes COVID-19
O GPAS agora também faz parte da Plataforma de Avaliaa§a£o de Novas Variantes da Saúde Paºblica da Inglaterra.
Por Oxford - 26/09/2021


A rápida disseminação da variante Delta altamente infecciosa ressalta a necessidade de identificação mais rápida de mutações COVID-19. Unindo governos e comunidades médicas neste desafio, a Universidade de Oxford e o Global Pathogen Analysis System (GPAS) da Oracle estãosendo usados ​​por organizações em quase todos os continentes. As instituições que usam a plataforma incluem: Centro de Pesquisa Hospitalar da Universidade de Montreal, Instituto de Pesquisa em Saúde Paºblica do Chile, Unidade de Pesquisa Cla­nica da Universidade de Oxford no Vietna£, Instituto de Patologia Cla­nica e Pesquisa Manãdica - Patologia de New South Wales e Oxford Nanopore Tecnologias. O GPAS agora também faz parte da Plataforma de Avaliação de Novas Variantes da Saúde Paºblica da Inglaterra.

Construa­do usando a Plataforma de Pathogen Pipeline (SP3), Oracle APEX e Oracle Cloud Infrastructure (OCI) da Oxford, o Global Pathogen Analysis System éuma plataforma em nuvem que fornece um sistema unificado e padronizado para analisar e comparar os dados de sequaªncia gena´mica anotada de SARS- CoV-2.

Oxford University e Oracle

Os pesquisadores estãousando o sistema para carregar dados de patógenos e receber resultados abrangentes em minutos. Com a permissão do usua¡rio, os resultados podem ser compartilhados com os laboratórios participantes em todo o mundo em um ambiente seguro. Tornar esses dados compreensa­veis e compartilha¡veis ​​ajudara¡ as autoridades de saúde pública a avaliar e planejar sua resposta, dando-lhes uma visão inestima¡vel das variantes emergentes, mesmo antes de serem oficialmente designadas como Variantes da Preocupação.

'Unindo a comunidade de pesquisa global em uma missão comum'


'GPAS éo primeiro serviço baseado em padraµes da indústria em qualquer lugar do mundo, oferecendo um serviço de análise de dados de sequaªncia padronizada para usuários na nuvem', disse Derrick Crook , professor de microbiologia do Departamento de Medicina de Nuffield da Universidade de Oxford.

'Os usuários sera£o capazes de acessar, carregar e processar seus dados de sequaªncia totalmente sob seu controle soberano e receber de volta os dados totalmente analisados ​​em apenas 20 minutos após o upload bem-sucedido. Se optarem por compartilhar dados, eles contribuira£o com visualizações de painel eletra´nico de dados globais, revelando asmudanças dia¡rias na forma como a pandemia estãoprogredindo e como o va­rus estãomudando. Isso permitira¡ uma avaliação conta­nua da pandemia e ajudara¡ a orientar as intervenções nacionais e globais para conter o impacto do va­rus. '

'COVID-19 éuma luta global, mas os pesquisadores não tinham a infraestrutura técnica para processar sequaªncias brutas com rapidez, segurança e compartilhar esses resultados em todo o mundo',

Larry Ellison.  

“Com o GPAS, estamos trazendo o poder e a segurança da nuvem para permitir que qualquer pesquisador, em qualquer local, se torne parte da solução. Quanto mais dados as instituições médicas, governos e acadaªmicos fornecerem, mais rapidamente podemos entender e agir para nos antecipar ao coronava­rus. ' 

Usando a plataforma, pesquisadores e governos podera£o acessar rapidamente os dados oportunos e relevantes de que precisam para fazer análises cienta­ficas atualizadas e decisaµes políticas e de segurança mais bem informadas em relação a novas variantes.

Como parte de seu trabalho com o Global Health Security Consortium (GHSC), o Lawrence J. Ellison Institute for Transformative Medicine (Ellison Institute) e o Tony Blair Institute (TBI) para Global Change trabalharam em coordenação com Oxford e Oracle para apoiar o desenvolvimento da plataforma e coloca¡-la nas ma£os de pesquisadores globais.

'A falta de preparação do mundo para a pandemia COVID-19 destacou nossa necessidade de trabalhar de maneira diferente para identificar soluções que sejam pragma¡ticas e possam ser escalonadas em face dos desafios', disse o Dr. David B. Agus, membro e CEO do GHSC , Instituto Ellison.

'GPAS éum bloco de construção chave na infraestrutura global de dados para sistemas de alerta precoce e vigila¢ncia global.'

"Sabemos muito bem que os va­rus não respeitam fronteiras, por isso devemos adotar uma abordagem global e obstinada para conter essa pandemia",

Tony Blair, presidente executivo da TBI e ex-primeiro-ministro do Reino Unido.  

'Esta plataforma promete reunir dados muito mais rapidamente, ajudando-nos a entender melhor e nos antecipar aos padraµes de propagação mais rapidamente, para que os governos possam tomar melhores decisaµes políticas e mitigar o impacto devastador que este va­rus continua a infligir em seus pra³priospaíses e atravanãs o Globo.' 

O Global Pathogen Analysis System estãosendo fornecido como um recurso gratuito para ajudar a combater o COVID-19 e outras ameaa§as microbianas a  saúde. Participe do programa e saiba mais em: https://www.gpas.cloud

 

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