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Oxford e Oracle fazem parceria para acelerar a identificação de variantes COVID-19
O GPAS agora também faz parte da Plataforma de Avaliação de Novas Variantes da Saúde Pública da Inglaterra.
Por Oxford - 26/09/2021


A rápida disseminação da variante Delta altamente infecciosa ressalta a necessidade de identificação mais rápida de mutações COVID-19. Unindo governos e comunidades médicas neste desafio, a Universidade de Oxford e o Global Pathogen Analysis System (GPAS) da Oracle estão sendo usados ​​por organizações em quase todos os continentes. As instituições que usam a plataforma incluem: Centro de Pesquisa Hospitalar da Universidade de Montreal, Instituto de Pesquisa em Saúde Pública do Chile, Unidade de Pesquisa Clínica da Universidade de Oxford no Vietnã, Instituto de Patologia Clínica e Pesquisa Médica - Patologia de New South Wales e Oxford Nanopore Tecnologias. O GPAS agora também faz parte da Plataforma de Avaliação de Novas Variantes da Saúde Pública da Inglaterra.

Construído usando a Plataforma de Pathogen Pipeline (SP3), Oracle APEX e Oracle Cloud Infrastructure (OCI) da Oxford, o Global Pathogen Analysis System é uma plataforma em nuvem que fornece um sistema unificado e padronizado para analisar e comparar os dados de sequência genômica anotada de SARS- CoV-2.

Oxford University e Oracle

Os pesquisadores estão usando o sistema para carregar dados de patógenos e receber resultados abrangentes em minutos. Com a permissão do usuário, os resultados podem ser compartilhados com os laboratórios participantes em todo o mundo em um ambiente seguro. Tornar esses dados compreensíveis e compartilháveis ​​ajudará as autoridades de saúde pública a avaliar e planejar sua resposta, dando-lhes uma visão inestimável das variantes emergentes, mesmo antes de serem oficialmente designadas como Variantes da Preocupação.

'Unindo a comunidade de pesquisa global em uma missão comum'


'GPAS é o primeiro serviço baseado em padrões da indústria em qualquer lugar do mundo, oferecendo um serviço de análise de dados de sequência padronizada para usuários na nuvem', disse Derrick Crook , professor de microbiologia do Departamento de Medicina de Nuffield da Universidade de Oxford.

'Os usuários serão capazes de acessar, carregar e processar seus dados de sequência totalmente sob seu controle soberano e receber de volta os dados totalmente analisados ​​em apenas 20 minutos após o upload bem-sucedido. Se optarem por compartilhar dados, eles contribuirão com visualizações de painel eletrônico de dados globais, revelando as mudanças diárias na forma como a pandemia está progredindo e como o vírus está mudando. Isso permitirá uma avaliação contínua da pandemia e ajudará a orientar as intervenções nacionais e globais para conter o impacto do vírus. '

'COVID-19 é uma luta global, mas os pesquisadores não tinham a infraestrutura técnica para processar sequências brutas com rapidez, segurança e compartilhar esses resultados em todo o mundo',

Larry Ellison.  

“Com o GPAS, estamos trazendo o poder e a segurança da nuvem para permitir que qualquer pesquisador, em qualquer local, se torne parte da solução. Quanto mais dados as instituições médicas, governos e acadêmicos fornecerem, mais rapidamente podemos entender e agir para nos antecipar ao coronavírus. ' 

Usando a plataforma, pesquisadores e governos poderão acessar rapidamente os dados oportunos e relevantes de que precisam para fazer análises científicas atualizadas e decisões políticas e de segurança mais bem informadas em relação a novas variantes.

Como parte de seu trabalho com o Global Health Security Consortium (GHSC), o Lawrence J. Ellison Institute for Transformative Medicine (Ellison Institute) e o Tony Blair Institute (TBI) para Global Change trabalharam em coordenação com Oxford e Oracle para apoiar o desenvolvimento da plataforma e colocá-la nas mãos de pesquisadores globais.

'A falta de preparação do mundo para a pandemia COVID-19 destacou nossa necessidade de trabalhar de maneira diferente para identificar soluções que sejam pragmáticas e possam ser escalonadas em face dos desafios', disse o Dr. David B. Agus, membro e CEO do GHSC , Instituto Ellison.

'GPAS é um bloco de construção chave na infraestrutura global de dados para sistemas de alerta precoce e vigilância global.'

"Sabemos muito bem que os vírus não respeitam fronteiras, por isso devemos adotar uma abordagem global e obstinada para conter essa pandemia",

Tony Blair, presidente executivo da TBI e ex-primeiro-ministro do Reino Unido.  

'Esta plataforma promete reunir dados muito mais rapidamente, ajudando-nos a entender melhor e nos antecipar aos padrões de propagação mais rapidamente, para que os governos possam tomar melhores decisões políticas e mitigar o impacto devastador que este vírus continua a infligir em seus próprios países e através o Globo.' 

O Global Pathogen Analysis System está sendo fornecido como um recurso gratuito para ajudar a combater o COVID-19 e outras ameaças microbianas à saúde. Participe do programa e saiba mais em: https://www.gpas.cloud

 

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