Em um estudo publicado na revista americana Science Advances , um mapa de tipo de canãlula única de tecidos humanos éapresentado. Um atlas de acesso aberto foi lana§ado com mais de 250.000 gra¡ficos interativos para permitir aos pesquisadores explorar a expressão em tipos de células individuais individuais para todos os genes que codificam protea­nas nesses tecidos.

O novo portal de conhecimento foi criado como parte do programa Human Protein Atlas baseado na Suanãcia (www.proteinatlas.org) combinando dados de células individuais com perfis baseados em anticorpos para permitir um mapa hola­stico de células, tecidos e órgãos do protea­nas em todo o corpo humano para atuar como uma base para pesquisas em biologia e doenças humanas.

As melhorias drama¡ticas no sequenciamento paralelo macia§o, juntamente com preparações de amostras de células únicas e deconvolução de dados, permitiram que o sequenciamento de RNA de uma única canãlula se tornasse uma abordagem poderosa para caracterizar células individuais . No artigo de Karlsson et al, a análise de canãlula única usando tanto o sequenciamento de RNA quanto o perfil baseado em anticorpos foram combinados para criar um mapa dispona­vel publicamente de 192 tipos de células humanas.

A análise destaca grupos de expressão distintos correspondentes a tipos de células que compartilham funções semelhantes, tanto dentro dos mesmos órgãos quanto entre órgãos. Uma classificação para mapear o perfil de expressão gaªnica de todos os genes codificadores de protea­nas nos diferentes tipos de células foi realizada para determinar o número de genes elevados em determinados tipos de células individuais e, portanto, mostrando alta ou baixa especificidade de tipo de canãlula. Em todos os tipos de células analisados, quase 14.000 genes mostraram uma expressão elevada em determinados tipos de células, dos quais aproximadamente 2.000 genes foram considerados específicos para apenas um dos tipos de células.

Os tipos de células nos testa­culos mostraram o maior número de genes elevados de tipos de células, seguidos por células ciliadas. Curiosamente, apenas 11% dos genes foram detectados em todos os tipos de células analisados, sugerindo que o número de genes essenciais ('manutenção') ésurpreendentemente pequeno.

"O artigo descreve uma adição importante ao Atlas de Protea­na Humana, que se tornou um dos bancos de dados biola³gicos mais visitados do mundo, abrigando milhões de pa¡ginas da web com informações sobre todos os genes codificadores de protea­nas humanas", disse Mathias Uhlanãn, Diretor do Human Consãorcio Protein Atlas.

"Estamos entusiasmados com o fato de que a nova seção de tipo de canãlula única de acesso aberto constitui um recurso exclusivo para estudar a especificidade do tipo de canãlula e a localização espacial exata de todas as nossas protea­nas", disse a Dra. Cecilia Lindskog, chefe do grupo HPA Tissue Profiling.