Em um artigo publicado hoje na Nature Genetics, cientistas da Universidade de Cambridge e do Centro de Pesquisa Biomédica de Cambridge do NIHR analisaram a sequência completa de DNA de 4.775 tumores de sete tipos de câncer. Eles usaram os dados do Projeto 100.000 Genomas da Genomics England para criar um algoritmo capaz de identificar tumores com falhas no DNA, o que os torna mais fáceis de tratar.

O algoritmo, chamado PRRDetect, poderá um dia ajudar os médicos a descobrir quais pacientes têm maior probabilidade de sucesso no tratamento. Isso pode abrir caminho para planos de tratamento mais personalizados, aumentando as chances de sobrevivência das pessoas.

A pesquisa foi financiada pela Cancer Research UK e pelo Instituto Nacional de Pesquisa em Saúde e Cuidados (NIHR).

A professora Serena Nik-Zainal, do Instituto do Câncer Precoce da Universidade de Cambridge, principal autora do estudo, afirmou: "O sequenciamento genômico agora é muito mais rápido e barato do que nunca. Estamos nos aproximando do ponto em que sequenciar seu tumor será tão rotineiro quanto um exame de imagem ou de sangue."

Para usar a genômica com mais eficácia na clínica, precisamos de ferramentas que nos forneçam informações significativas sobre como o tumor de uma pessoa pode responder ao tratamento. Isso é especialmente importante em cânceres com menor sobrevida, como câncer de pulmão e tumores cerebrais.

Cânceres com reparo de DNA defeituoso têm maior probabilidade de serem tratados com sucesso. O PRRDetect nos ajuda a identificar melhor esses cânceres e, à medida que sequenciamos cada vez mais cânceres rotineiramente na clínica, ele pode, em última análise, ajudar os médicos a adaptar melhor os tratamentos a cada paciente.

A equipe de pesquisa procurou padrões no DNA criados pelas chamadas mutações "indel", nas quais letras são inseridas ou excluídas da sequência normal de DNA.  

Eles encontraram padrões incomuns de mutações indel em cânceres que apresentavam mecanismos de reparo de DNA defeituosos – conhecidos como "disfunção de reparo pós-replicativo" ou PRRd. Usando essas informações, os cientistas desenvolveram o PRRDetect para permitir a identificação de tumores com essa falha a partir de uma sequência completa de DNA.

Os tumores PRRd são mais sensíveis à imunoterapia, um tipo de tratamento contra o câncer que utiliza o próprio sistema imunológico do corpo para atacar as células cancerígenas. Os cientistas esperam que o algoritmo PRRd possa atuar como um "detector de metais", permitindo-lhes identificar pacientes com maior probabilidade de sucesso no tratamento com imunoterapia.

O estudo é consequência de uma "escavação arqueológica" anterior de genomas de câncer realizada pelo professor Nik-Zainal, que examinou os genomas de dezenas de milhares de pessoas e revelou padrões de mutações nunca antes vistos, que estão ligados ao câncer.

Desta vez, a Professora Nik-Zainal e sua equipe analisaram cânceres que apresentam uma proporção maior de tumores com PRRd. Entre eles, estão os cânceres de intestino, cérebro, endométrio, pele, pulmão, bexiga e estômago. Sequências completas do genoma desses cânceres foram fornecidas pelo Projeto 100.000 Genomas – um estudo pioneiro liderado pela Genomics England e pelo NHS England, que sequenciou 100.000 genomas de cerca de 85.000 pacientes do NHS afetados por doenças raras ou câncer.

O estudo identificou 37 padrões diferentes de mutações indel nos sete tipos de câncer incluídos. Dez desses padrões já estavam associados a causas conhecidas de câncer, como tabagismo e exposição à luz UV. Oito desses padrões estavam associados ao PRRd. Os 19 padrões restantes eram novos e poderiam estar associados a causas de câncer ainda não totalmente compreendidas ou a mecanismos dentro das células que podem dar errado quando uma célula se torna cancerosa.

O Diretor Executivo de Pesquisa e Inovação da Cancer Research UK, Dr. Iain Foulkes, afirmou: “A medicina genômica revolucionará a forma como abordamos o tratamento do câncer. Agora podemos obter leituras completas do DNA tumoral com muito mais facilidade, e com isso vem uma riqueza de informações sobre como o câncer de um indivíduo pode começar, crescer e se espalhar.

Ferramentas como o PRRDetect tornarão o tratamento personalizado do câncer uma realidade para muitos mais pacientes no futuro. A personalização do tratamento tem muito mais chances de sucesso, garantindo que mais pessoas possam viver vidas mais longas e melhores, sem o medo do câncer.

O diretor científico do NIHR, Mike Lewis, disse: “O câncer é uma das principais causas de morte no Reino Unido, então é impressionante ver nossa pesquisa levar à criação de uma ferramenta para determinar qual terapia levará a uma maior probabilidade de sucesso no tratamento do câncer.”

O diretor científico da Genomics England, professor Matt Brown, disse: “A genômica está desempenhando um papel cada vez mais importante na área da saúde e essas descobertas mostram como os dados genômicos podem ser usados para impulsionar cuidados mais preditivos e preventivos, levando a melhores resultados para pacientes com câncer.

“A criação deste algoritmo demonstra o imenso valor do sequenciamento do genoma completo, não apenas na pesquisa, mas também na clínica, em diversos tipos de câncer, promovendo o avanço do tratamento do câncer.”

A Universidade de Cambridge está arrecadando fundos para um novo hospital que transformará a forma como diagnosticamos e tratamos o câncer. O Cambridge Cancer Research Hospital, uma parceria com o Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust, atenderá pacientes em todo o leste da Inglaterra, mas a pesquisa realizada lá promete mudar a vida de pacientes com câncer em todo o Reino Unido e além. Saiba mais aqui .

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