Uma análise macia§a de todo o genoma de 2.658 pessoas com 39 tipos diferentes de câncer identificou mutações em 179 genes e reguladores genanãticos como “drivers” - variações nas sequaªncias de DNA que levam ao desenvolvimento do ca¢ncer.

O trabalho faz parte do projeto de Ana¡lise de Ca¢ncer Pan-Integral (PCAWG), um dos estudos gena´micos mais abrangentes atéo momento, envolvendo cientistas de 17países e mais de 30 artigos, incluindo vários da faculdade de Yale publicados em vários peria³dicos anteriores este maªs.

Embora os motoristas representassem uma grande porcentagem dos casos de câncer analisados, eles não explicaram tudo. Alguns cientistas, incluindo Mark Gerstein, de Yale, agora acreditam que, para capturar uma visão mais panora¢mica da progressão do ca¢ncer, eles precisam prestar mais atenção não apenas aos fatores genanãticos cla¡ssicos, mas também aos "passageiros" - as milhares de mutações que não constituem os esmagadora maioria das mutações observadas em um genoma ta­pico de ca¢ncer. Historicamente, o consenso cienta­fico sustentou que estes não desempenham nenhum papel no crescimento do tumor.

" Muitas dessas mutações podem ter pequenos efeitos individuais, mas um efeito cumulativo considera¡vel, no desenvolvimento do ca¢ncer", disse Gerstein, professor de informa¡tica biomédica de Albert L. Williams; professor de biofa­sica molecular e bioquímica, de ciência da computação e de estata­stica e ciência de dados; e autor saªnior de um artigo publicado na Cell em 20 de fevereiro que descreve o papel dos passageiros no desenvolvimento do câncer .

Compreender as raa­zes genanãticas de como as células cancera­genas se formam a partir de células sauda¡veis, se replicam e migram para diferentes órgãos e como esse processo varia entre tipos de tumores e entre indivíduos écrucial para a criação de novas estratanãgias para combater o ca¢ncer, uma das principais causas de morte no mundo.

Gerstein, Sushant Kumar, cientista associado de pesquisa no laboratório de Gerstein, e colegas decidiram considerar o papel dos "passageiros" no desenvolvimento do ca¢ncer. No artigo da Cell, eles relatam experimentos destinados a mostrar se mutações de passageiros podem ajudar a explicar os 10% dos casos de câncer nos quais os pesquisadores encontraram poucos ou nenhum driver genanãtico claro. Eles descobriram que um subconjunto de passageiros tem um impacto significativo nas regiaµes gena´micas - muitas vezes tanto impacto quanto os motoristas - e coletivamente podem ter um efeito aprecia¡vel no crescimento do tumor.

A equipe de Yale também conduziu uma análise estata­stica focada de oito tipos diferentes de ca¢ncer, detectando um efeito cumulativo dos passageiros no desenvolvimento desses ca¢nceres além do que poderia ser explicado apenas pelos motoristas. No geral, suas análises mostraram uma contribuição adicional de 9% dos passageiros na previsão de se uma determinada amostra era realmente cancera­gena.

Gerstein enfatizou que algumas dessas variantes de passageiros podem realmente ajudar a impedir o desenvolvimento do ca¢ncer, em vez de desencadear o crescimento do tumor. Compreender o papel completo dos passageiros pode ajudar os cientistas a desenvolver terapias direcionadas precisamente a s mutações individuais no genoma do câncer de uma pessoa em particular, dizem os autores.

Outros trabalhos no PCAWG ou usando dados do PCAWG envolvendo pesquisadores de Yale publicados em revistas da Nature são relatados aqui.