SARS-CoV-2 éum dos muitos coronava­rus. Todos compartilham a caracterí­stica de ter o maior genoma de RNA de fita simples da natureza. Esse genoma contanãm todo o ca³digo genanãtico de que o va­rus precisa para produzir protea­nas, escapar do sistema imunológico e se replicar dentro do corpo humano. Muitas dessas informações estãocontidas na estrutura 3D adotada por esse genoma de RNA quando ele infecta as células.  

Os pesquisadores dizem que a maioria dos trabalhos atuais para encontrar drogas e vacinas para COVID-19 estãofocada em alvejar as protea­nas do va­rus. Como a forma da molanãcula de RNA écra­tica para sua função, direcionar o RNA diretamente com drogas para interromper sua estrutura bloquearia o ciclo de vida e interromperia a replicação do va­rus.

Em um estudo publicado hoje na revista Molecular Cell , a equipe descobriu toda a estrutura do genoma SARS-CoV-2 dentro da canãlula hospedeira, revelando uma rede de interações RNA-RNA que abrangem seções muito longas do genoma. Diferentes partes funcionais ao longo do genoma precisam trabalhar juntas, apesar da grande distância entre elas, e os novos dados estruturais mostram como isso éfeito para permitir o ciclo de vida do coronava­rus e causar doena§as.

“O genoma de RNA dos coronava­rus écerca de três vezes maior do que um genoma de RNA viral comum - éenorme”, disse o autor principal, Dr. Omer Ziv, do Wellcome Trust / Cancer Research UK Gurdon Institute da Universidade de Cambridge.

Ele acrescentou: “Os pesquisadores propuseram anteriormente que as interações de longa distância ao longo dos genomas do coronava­rus são cra­ticas para sua replicação e para a produção de protea­nas virais, mas atérecentemente não ta­nhamos as ferramentas certas para mapear essas interações por completo. Agora que entendemos essa rede de conectividade, podemos comea§ar a projetar maneiras de direciona¡-la de forma eficaz com a terapaªutica. ”

Em todas as células, o genoma contanãm o ca³digo para a produção de protea­nas especa­ficas, que são feitas quando uma ma¡quina molecular chamada ribossomo corre ao longo do RNA lendo o ca³digo atéque um 'sinal de parada' diga para ele terminar. Nos coronava­rus, existe um local especial onde o ribossomo para apenas 50% das vezes em frente ao sinal de parada. Nos outros 50% dos casos, uma forma única de RNA faz o ribossomo pular o sinal de parada e produzir protea­nas virais adicionais. Ao mapear essa estrutura de RNA e as interações de longo alcance envolvidas, a nova pesquisa revela as estratanãgias pelas quais os coronava­rus produzem suas protea­nas para manipular nossas células. 

“Na³s mostramos que as interações ocorrem entre seções do RNA SARS-CoV-2 que estãoa distâncias muito longas, e podemos monitorar essas interações a  medida que ocorrem durante a replicação inicial do SARS-CoV-2”, disse a Dra. Lyudmila Shalamova, uma pesquisador principal da Universidade Justus-Liebig, Alemanha.

O Dr. Jon Price, pa³s-doutorando associado no Gurdon Institute e co-lider deste estudo, desenvolveu um site interativo de acesso aberto e gratuito que hospeda toda a estrutura de RNA do SARS-CoV-2. Isso permitira¡ que pesquisadores em todo o mundo usem os novos dados no desenvolvimento de drogas para atingir regiaµes especa­ficas do genoma do RNA do va­rus.

O genoma da maioria dos va­rus humanos éfeito de RNA, e não de DNA. Ziv desenvolveu manãtodos para investigar essas interações de longo alcance em genomas de RNA virais dentro das células hospedeiras, em um trabalho para entender o genoma do va­rus Zika. Isso provou ser uma base metodola³gica valiosa para a compreensão do SARS-CoV-2. 

Esta pesquisa éum estudo colaborativo entre o grupo do Professor Eric Miska do Instituto Gurdon e Departamento de Genanãtica da Universidade de Cambridge, e o grupo do Professor Friedemann Weber do Instituto de Virologia da Justus-Liebig University, GieaŸen, Alemanha. Os autores agradecem o apoio do Departamento de Bioquímica da Universidade de Cambridge, que disponibilizou laboratórios especializados para a realização de parte desta pesquisa.