Pesquisadores do Instituto Europeu de Bioinforma¡tica do EMBL (EMBL-EBI), do Instituto Nacional de Pesquisa do Genoma Humano (NIH) do Instituto Nacional de Pesquisa do Genoma Humano (NHGRI), do Instituto Nacional de Artrite e Doena§as Musculoesquelanãticas e de Pele do NIH e colegas identificaram novas espanãcies bacterianas e fúngicas , bem como va­rus no microbioma da pele humana.

Microbiomas - comunidades de microrganismos - são encontrados em todos os lugares, desde os oceanos e o solo atéo intestino humano e asuperfÍcie da pele . Acredita-se que o microbioma da pele desempenhe um papel fundamental na saúde e nas doenças da pele. Certos microrganismos no microbioma da pele estãoassociados a diferentes doenças da pele, incluindo acne e eczema.

Neste estudo, publicado na Nature Microbiology , os pesquisadores sequenciaram os genomas dos microrganismos detectados em 594 amostras retiradas de váriassuperfÍcies da pele de 12 voluntários sauda¡veis. Combinando o cultivo de laboratório tradicional com uma abordagem de sequenciamento metagena´mico, os pesquisadores foram capazes de criar a Skin Microbial Genome Collection (SMGC) - uma coleção de genomas de referaªncia para o microbioma da pele humana.

"Descobrimos milhares de sequaªncias virais , incluindo muitos fagos jumbo - va­rus muito grandes que infectam bactanãrias - mais comumente nasuperfÍcie das ma£os e panãs de nossos voluntários", disse Sara Kashaf, Ph.D. estudante do NIH e do EMBL-EBI. "Essas áreas do corpo tem microbiomas altamente diversos, o que faz sentido porque estamos constantemente usando nossas ma£os para tocar novas coisas em nosso ambiente. Nosso trabalho futuro tera¡ como objetivo entender o que esses diferentes micróbios estãofazendo nessas comunidades."

Os pesquisadores usaram manãtodos extensivos de cultura de laboratório, sequenciamento metagena´mico e metagenomas de pele disponí­veis ao paºblico para obter esses novos insights sobre a extensão da diversidade dentro do microbioma da pele. Este estudo focou principalmente em indivíduos da Amanãrica do Norte, mas o trabalho futuro tera¡ como objetivo expandir o SMGC usando amostras de diferentes populações.

"Este trabalho éum passo importante para a obtenção de um projeto gena´mico completo do microbioma da pele", disse Julie Segre, pesquisadora saªnior do NHGRI. "Esperamos que esses dados apoiem futuras investigações, melhorando nossa compreensão da saúde e doenças da pele."

A coleção SMGC inclui 174 espanãcies bacterianas atéentão desconhecidas, quatro novos eucariotos e 20 novos fagos jumbo - va­rus com um genoma maior do que 200 kilobases, 3-5 vezes maior do que um va­rus manãdio. Os pesquisadores trabalharam anteriormente com um conhecimento incompleto da composição bacteriana do microbioma da pele. No entanto, esta pesquisa expande o cata¡logo de bactanãrias cuta¢neas conhecidas em 26%.

"Além das bactanãrias e va­rus que normalmente recuperamos na metagena´mica, também encontramos doze genomas de eucariotos unicelulares - fungos, como leveduras - da pele humana. Alguns desses genomas já eram conhecidos, como Malassezia globosa, que tem foi associado ao micobioma de pele sauda¡vel, mas também foi associado a doenças como a caspa. Usar os mesmos manãtodos que recuperaram oito genomas conhecidos nos da¡ confianção nos quatro novos eucariotos que encontramos ", disse Rob Finn, lider do grupo EMBL-EBI . "Observar os padraµes desses novos eucariotos revelou que um deles era muito comum entre os voluntários e pode ser encontrado em muitos de nós."

Todos esses dados sera£o disponibilizados gratuitamente em breve como um novo cata¡logo de genoma no recurso de dados MGnify, onde os pesquisadores podem encontrar uma grande variedade de conjuntos de dados de microbioma, incluindo para o intestino humano .