Identificar doenças zoona³ticas antes da emergaªncia éum grande desafio porque apenas uma pequena minoria dos estimados 1,67 milhões de varus animais são capazes de infectar humanos

Morcegos capturados durante esforços de vigila¢ncia de varus zoona³ticos (Madre de Dios, Peru). Crédito: Daniel Streicker, Mollentze N, et al., PLOS Biology , CC-BY 4.0 (creativecommons.org/licenses/by/4.0/)
A maioria das doenças infecciosas emergentes em humanos (como COVID-19) são zoona³ticas - causadas por varus origina¡rios de outras espanãcies animais. A identificação precoce de varus de alto risco pode melhorar as prioridades de pesquisa e vigila¢ncia. Um estudo publicado na PLOS Biology em 28 de setembro por Nardus Mollentze, Simon Babayan e Daniel Streicker da University of Glasgow, Reino Unido, sugere que o aprendizado de ma¡quina (um tipo de inteligaªncia artificial) usando genomas virais pode prever a probabilidade de qualquer varus infectante de animais ira¡ infectar humanos, dada a exposição biologicamente relevante.
Identificar doenças zoona³ticas antes da emergaªncia éum grande desafio porque apenas uma pequena minoria dos estimados 1,67 milhões de varus animais são capazes de infectar humanos. Para desenvolver modelos de aprendizado de ma¡quina usando sequaªncias do genoma viral, os pesquisadores primeiro compilaram um conjunto de dados de 861 espanãcies de varus de 36 famalias. Eles então construaram modelos de aprendizado de ma¡quina, que atribuaram uma probabilidade de infecção humana com base na taxonomia do varus e / ou relação com varus conhecidos que infectam humanos. Os autores então aplicaram o modelo de melhor desempenho para analisar padraµes no potencial zoona³tico previsto de genomas de varus adicionais amostrados de uma variedade de espanãcies.
Os pesquisadores descobriram que os genomas virais podem ter caracteristicas generaliza¡veis ​​que são independentes das relações taxona´micas do varus e podem pré-adaptar os varus para infectar humanos. Eles foram capazes de desenvolver modelos de aprendizado de ma¡quina capazes de identificar zoonoses candidatas usando genomas virais. Esses modelos tem limitações, pois os modelos de computador são apenas uma etapa preliminar da identificação de varus zoona³ticos com potencial para infectar humanos. Os varus sinalizados pelos modelos exigira£o testes laboratoriais de confirmação antes de realizar grandes investimentos adicionais em pesquisas. Além disso, embora esses modelos prevejam se os varus podem infectar humanos, a capacidade de infectar éapenas uma parte do risco zoona³tico mais amplo, que também éinfluenciado pela virulência do varus em humanos, capacidade de transmissão entre humanos,
De acordo com os autores, "Nossos resultados mostram que o potencial zoona³tico dos varus pode ser inferido em uma extensão surpreendentemente grande de sua sequaªncia de genoma . Ao destacar os varus com maior potencial para se tornarem zoona³ticos, a classificação baseada no genoma permite uma caracterização ecola³gica e virola³gica adicional para ser direcionado de forma mais eficaz. "
"Essas descobertas adicionam uma pea§a crucial a já surpreendente quantidade de informações que podemos extrair da sequaªncia genanãtica de varus usando técnicas de IA", acrescenta Babayan. "Uma sequaªncia gena´mica énormalmente a primeira, e muitas vezes a única, informação que temos sobre varus recanãm-descobertos, e quanto mais informações podemos extrair dela, mais cedo podemos identificar as origens do varus e o risco zoona³tico que ele pode representar. Quanto mais varus forem caracterizados, mais eficazes nossos modelos de aprendizado de ma¡quina se tornara£o na identificação de varus raros que devem ser monitorados de perto e priorizados para o desenvolvimento de vacinas preventivas. "