Em uma nova pesquisa do Pacific Northwest National Laboratory (PNNL), os cientistas usaram bioinforma¡tica e sequenciamento profundo para identificar varus do solo e entender melhor seus papanãis na Terra.

Domanio paºblico
O solo éo hera³i desconhecido de nossas vidas. Ele fornece nutrição a s culturas para nos fornecer alimentos, oferece drenagem para a águada chuva em aquaferos e éum habitat para uma variedade de organismos. Nonívelmicrosca³pico, o solo prospera com vida, abrigando micróbios, como fungos e bactanãrias que trabalham cooperativamente com as plantas. Apesar de ser uma parte tão importante de nossas vidas, pouco se sabe exatamente sobre o que existe logo abaixo dasuperfÍcie da Terra.
Em uma nova pesquisa do Pacific Northwest National Laboratory (PNNL), os cientistas usaram bioinforma¡tica e sequenciamento profundo para identificar varus do solo e entender melhor seus papanãis na Terra. A maioria desses varus infecta bactanãrias e, portanto, acredita-se que desempenhe um papel importante na manutenção das populações microbianas.
"Os varus são abundantes na natureza", disse Janet Jansson, cientista-chefe de biologia e bolsista do PNNL Laboratory. “Como hámuitos deles em cada amostra de solo, identificar diferentes varus se torna um desafioâ€.
Jansson trabalhou com o cientista computacional Ruonan Wu e a cientista da Terra e lider da equipe de ciências do microbioma Kirsten Hofmockel na Divisão de Ciências Biola³gicas do PNNL para enfrentar esse desafio.
Junto com colaboradores da Washington State University; Universidade de Saúde e Ciências de Oregon; Universidade Estadual de Iowa; e EMSL, o Laborata³rio de Ciências Moleculares Ambientais, uma instalação de usuários do Departamento de Energia do Escrita³rio de Ciências do PNNL; os cientistas do PNNL coletaram amostras de solo de pastagens em Washington, Iowa e Kansas e começam um mergulho profundo na composição do solo. Eles aproveitaram as enormes habilidades de sequenciamento de DNA do Joint Genome Institute, o poder de computação do National Energy Research Scientific Computing Center e a experiência em multi-a´mica do EMSL para descobrir varus do solo anteriormente desconhecidos. Seus resultados foram publicados na mBio e Communications Biology .
Varus diferentes para climas diferentes
Os cientistas escolheram Washington, Iowa e Kansas para suas amostras de solo porque cada local recebe uma quantidade diferente de chuva. O leste de Washington émuito mais seco em comparação com Iowa, enquanto o Kansas fica na encruzilhada entre os dois em termos de umidade do solo.
“Escolhemos coletar amostras de locais com diferentes quantidades de umidade do solo para ver se isso fazia diferença nos tipos e quantidades de varus la¡â€, disse Wu. “O solo mais aºmido contanãm mais bactanãrias, e muitos varus do solo infectam bactanãriasâ€.
Os cientistas notaram que certos varus são muito mais abundantes em solo seco do que em solo aºmido.
"Em climas mais secos, tende a haver menos micróbios, poranãm mais diversificados, no solo", disse Wu. “A relativa escassez de hospedeiros bacterianos significa que édo interesse do varus manter o hospedeiro vivoâ€.
Os pesquisadores também descobriram que em solos mais secos, os varus eram mais propensos a conter genes especiais que poderiam potencialmente transferir para seus hospedeiros bacterianos.
"Esses genes poderiam dar a seus hospedeiros bacterianos 'superpoderes'", disse Jansson. “Esses genes de varus podem ser passados ​​para seus hospedeiros bacterianos para ajuda¡-los a sobreviver em solos secosâ€.
Embora mais pesquisas sejam necessa¡rias para entender melhor o papel desses genes virais especiais, a possibilidade de que eles possam ser aºteis para as bactanãrias que vivem no solo éempolgante. Esses genes podem ser aºteis para as bactanãrias , aumentando sua capacidade de reciclar carbono e, assim, aumentar a saúde do solo.