Um novo protocolo de sequenciamento de RNA de canãlula única desenvolvido no Institute of Molecular and Clinical Ophthalmology Basel (IOB) permite a detecção de um número significativamente maior de genes por canãlula do que qualquer manãtodo existente. Tambanãm émais rápido, menos caro e mais sensa­vel. O novo manãtodo já foi publicado na Nature Biotechnology .

O sequenciamento de RNA de canãlula única (scRNA-seq) mostra quais genes estãoativados em uma canãlula e qual éseunívelde transcrição. Isso permite uma avaliação aprofundada da biologia de células individuais e a detecção de alterações que podem indicar a doença . scRNA-seq estãose tornando amplamente utilizado em várias disciplinas, incluindo biologia do desenvolvimento, neurologia, oncologia, imunologia, pesquisa cardiovascular e doenças infecciosas. a‰ fundamental para estudar a heterogeneidade populacional, identificar subpopulações minorita¡rias de interesse e descobrir caracteri­sticas únicas de células individuais. As aplicações va£o muito além da oftalmologia: o sequenciamento de canãlula única éamplamente utilizado para a análise de mutações de novo na linha germinativa e mutações soma¡ticas em células normais e doentes; por exemplo, em células cancerosas.

O protocolo desenvolvido no IOB, com cientistas do Novartis Institutes for BioMedical Research, pode ser usado para estudar qualquer modelo de doença que exija a análise de populações de células raras em alta resolução. Simone Picelli, chefe da plataforma de gena´mica de canãlula única da IOB e autora saªnior do artigo, explica: "Nosso protocolo modular FLASH-seq fornece um instanta¢neo do transcriptoma da canãlula em uma resolução sem precedentes. O manãtodo pode ser miniaturizado, automatizado e adaptado para diferentes necessidades. Ajuda a definir quais isoformas de genes estãopresentes na saúde e na doena§a. Tambanãm fornece uma imagem muito mais profunda da expressão gaªnica, especialmente após perturbações devido a doena§as, defeitos de desenvolvimento ou agentes externos. Além disso, éfa¡cil de configurar no laboratório,

O novo manãtodo pode gerar bibliotecas prontas para sequenciamento em apenas meio dia. Pesquisadores do IOB, portanto, acreditam que o FLASH-seq tem o potencial de se tornar a ferramenta de escolha ao procurar um protocolo scRNA-seq de comprimento completo eficiente, robusto, modular, acessa­vel e amiga¡vel para automação .